DNAコピー数計算機
DNA質量と塩基対単位でのフラグメントまたはプラスミド長を入力すると、二本鎖DNAを仮定して存在するDNA分子(コピー)数を推定します。
最終更新日： September 25, 2026
よくある質問
塩基対あたり650g/molという数値はどこから来ていますか?
これは二本鎖DNAの塩基対1つあたりの一般的に使用される平均分子量であり(両方の鎖、糖-リン酸骨格および対になった塩基を考慮)、4種類の可能な塩基対の平均分子量から導かれています。これは平均値であり、特定の配列に対する正確な数値ではありません。実際の分子量は配列のGC含量によってわずかに変動するためです。
これはRNAや一本鎖DNAにも使えますか?
この計算機のデフォルトの仮定(単位あたり650g/mol)は、特に二本鎖DNA用に較正されています。一本鎖核酸とRNAはヌクレオチドあたりの平均分子量が異なるため、これらの試料タイプにdsDNAの数値を適用すると、不正確なコピー数の推定値になります。
なぜ結果は科学的記数法を使用するのですか?
DNAのコピー数は、少量の質量であっても非常に大きくなることが多く(数十億から数兆分子)、科学的記数法(1.234×10¹²など)を使用することで、扱いにくい桁数の文字列にならずに結果を読みやすく正確に保てます。これは分子生物学でこの種の大きな数値を報告する標準的な方法です。
これはDNA濃度計算機とどう違いますか?
DNA濃度計算機は、吸光度測定からサンプルの濃度(体積あたりの質量、ng/µLなど)を求めます。このDNAコピー数計算機は代わりに、分子の長さに基づいて、与えられた質量中にどれだけの個々のDNA分子が存在するかを推定します。濃度とコピー数は関連していますが異なる測定値であり、このツールは特に「分子の数」という問いに答えるものです。
プラスミドのサイズは同じ質量から得られるコピー数に影響しますか?
はい、大きく影響します。同じ総DNA質量に対して、短いプラスミドまたはフラグメントは、長いものよりもはるかに多くの個々の分子(コピー)を含みます。これは、より長い配列の各個別の分子がより重いためです。これが、コピー数の計算が常に質量だけでなくDNAの長さを必要とする理由です。
この計算は定量PCR(qPCR)の標準曲線に十分正確ですか?
標準を準備するための妥当な出発点の見積もりを提供しますが、実際のqPCR定量精度は、この理想化された計算を超えた多くの追加要因(ピペッティングの精度、DNAの純度、正確なGC含量など)に依存します。多くの研究室では、計算された見積もりのみに頼るのではなく、標準濃度を経験的にも検証しています。